Mara Wilson urodziła się w Los Angeles w żydowskiej rodzinie. Jej rodzicami są Michael Wilson i Suzie Shapiro Wilson, ma także trzech starszych braci oraz młodszą siostrę.
Gdy Mara miała pięć lat, jej najstarszy brat Danny zaczął grać w reklamach telewizyjnych i Mara zapragnęła pójść w jego ślady. Po występach w kilku reklamach (m. in. firm Texaco oraz Bank of America), debiutowała na srebrnym ekranie w 1993 roku w filmie "
Pani Doubtfire" u boku
Robina Williamsa, a następnie zagrała w filmie "
Cud na 34. ulicy". Swoimi występami zwróciła uwagę
Danny'ego DeVito i została obsadzona w tytułowej roli w filmie "
Matylda". Podczas kręcenia filmu, gdy Mara miała zaledwie 9 lat, jej matka zmarła na raka piersi.
Mara jest laureatką Young Artist Award za rolę w "
Prostym życzeniu" i Young Star Award za "
Matyldę", została również dwukrotnie nominowana do nagrody Saturn. Jak dotąd jej ostatnim występem na dużym ekranie był film "
Thomas i magiczna kolejka" z 2000 roku.
W 2005 roku Mara Wilson ukończyła Idyllwild Arts Academy, a następnie w 2009 roku Tisch School of the Arts, będącą jedną ze szkół Uniwersytetu Nowojorskiego.