W październiku 1945 roku, polska kobieta w szpitalu rozpoznaje w młodym Niemcu SS-mana który zamordował jej córkę. Niebuhr (Sylvester Groth) najpierw zostaje umieszczony w izolatce. Potem trafia do celi z byłymi oficerami SS. Tam Niebuhr powoli poznaje ogrom zbrodni hitlerowskich.

Warszawa, rok 1945. Maszerujące kolumny jeńców niemieckich. Kobieta wskazuje na jednego z nich jako zbrodniarza wojennego. 19-letni Mark Niebuhr, drukarz, zmobilizowany przed kilkoma miesiącami, zostaje odłączony od kolumny i zamknięty w więzieniu, gdzie zaczyna się jego tytułowy Pobyt. Film pokazuje nie tylko różnorodność stosunku Niemców do hitleryzmu, ale także wycinek polskiej rzeczywistości roku 1945, ukazanej z zupełnie odmiennego punktu widzenia.