Po wydarzeniach z pierwszej części obowiązki kronikarskie przejmuje Irulan (Florence Pugh), córka Imperatora (Christopher Walken), rozmyślając nad konsekwencjami planu wytępienia Atrydów... Tymczasem Paul (Timothée Chalamet) wraz z będącą w ciąży matką Jessicą (Rebecca Ferguson) ukrywa się na pustyni wśród Fremenów. Ich przywódca Stilgar (Javier Bardem) obserwuje wyczyny jedynego potomka Atrydów i jest przekonany, że to właśnie jest Wybraniec, co było przepowiadane wśród jego ludu od pokoleń. Aby jednak zostać zaakceptowanym przez Fremenów, Paul musi przejść ostateczny test, dosiadając jednego z gigantycznych robaków piaskowych. Kiedy o rzekomym proroku dowiaduje się ród Harkonennów, baron (Stellan Skarsgard) przeprowadza atak za atakiem, chcąc całkowicie przejąć kontrolę nad Arrakis...

Makiaweliczny ród Harkonnenów przejął kontrolę nad pustynną planetą Arrakis. Jednak rzeź udało się przeżyć Paulowi Atrydzie, synowi zamordowanego władcy, oraz jego matce Jessice. Oboje znajdują schronienie u plemienia Fremenów, którego członkowie widzą w Paulu wyczekiwanego od lat mesjasza. Z ich pomocą młody bohater próbuje odzyskać władzę nad planetą.