"Tomb Raider: Chronicles" składa się z czterech różnych epizodów. W pierwszym Lara wyruszy do Rzymu w poszukiwaniu kamienia filozoficznego. Przedmiotem tym są również zainteresowani znani z pierwszej części sagi, Pierre i Larson. W kolejnym wybierze się w podróż do Rosji. Jej celem stanie się legendarna Włócznia Przeznaczenia. Aby zdobyć ten artefakt, panna Croft skonfrontuje się z rosyjską mafią. Fabuła trzeciego przeniesie nas na tajemniczą irlandzką wyspę. Wraz z ojcem Patrickiem, nastoletnia Lara przekona się, że owa wyspa posiada więcej tajemnic niż przypuszczano. Szesnastolatka będzie zmuszona przetrwać bez jakiejkolwiek broni. W ostatnim epizodzie miliarderka postara się odebrać swojemu byłemu mentorowi - Wernerowi von Croyowi - znany już z czwartej części, artefakt Iris. Croft będzie musiała dostać się na szczyt nowoczesnego wieżowca Von Croy Instrudies, omijając technologiczne pułapki i zabójczych strażników.