Stephen Hawking napisał program, który pozwala przyzywać demony i rozsyła go losowym ludziom przez internet. Yukio Mishima próbuje to wykorzystać do przyzwania Lucyfera do Tokio. Można próbować mu w tym pomóc, bądź przeszkodzić sprzymierzając się z opozycją - amerykańskim ambasadorem Thormanem(nawiązanie do prezydenta H. Trumana). Wybór jednak nie ma większego znaczenia, bo ambasador okazuje się nordyckim bogiem Thorem i używa broni nuklearnej do zniszczenia Tokio. Druga część gry dzieje się 30 lat po apokalipsie w świecie rozdartym między chrześcijanami, którzy próbują zniszczyć demony i zaprowadzić rządy teokratyczne, oraz kultem który próbuje zawrzeć układ z demonami. Potem dostajemy zbroję Jezusa. Vishnu ma solówkę z jakimś innym bogiem i używamy go jako pokemona do sklepania anioła Michaela. Koniec gry.