"Fear Effect" to opowieść o grupie najemników, w skład której wchodzą Hana Tsu Vachel, Royce Glas oraz Jacos "Deke" DeCourt. Akcja gry rozpoczyna się w Hong Kongu, gdzie główni bohaterowie przybywają w celu odnalezienia Wee Ming - zaginionej córki bogatego przedsiębiorcy, Lama. Ich plan polega na odnalezieniu dziewczyny, porwaniu jej, a następnie zarobieniu sporych pieniędzy na okupie. Jak się jednak okaże, to zadanie nie będzie takie proste.