Tematyką tego anime jest walka ze złem tego świata o uratowanie gatunku ludzkiego, który Enkidu chce zniszczyć, aby powstał nowy byt, o wiele doskonalszy od ludzkiego.
Enkidu czyli Terumichi Madoka, ojciec dwójki rodzeństwa: Tatsui i Kiyoko, powoduje atak terrorystyczny. W instytucie badawczym zwanym Wrotami Niebios przeprowadzano różne eksperymenty, np. klonowano. Przez dojście do Delphys i połączenie się z T.E.A.R. profesor Madoka spowodował ogromny wybuch, który na wiele lat zakrył niebo lustrzaną, nieprzepuszczalną powłoką mieniącą się różnymi kolorami o nazwie Osłona Nieba. Matka Kiyoko i Tatsui zadłużyła się u ludzi z mafii i zmarła. Według umowy Kiyoko miała sprzedać ciało, a Tatsuya organy, zamiast pieniędzy. Podczas ucieczki rodzeństwo natknęło się na dom, w którym spotkało dziesięciu członków Gilgamesha: Novema, Sexa, Una, Septema, Tria, Decema, Octa, Dua, Quattuora i Quincea.
Jak dalej potoczyły się losy Tatsuo i Kiyoko?