W odległej części galaktyki leży Dwanaście Kolonii. Cywilizacje te od czterdziestu lat są w pokoju z imperium maszyn. Cylony, które zostały stworzone jako robotnicze drony dla ludzkości, zbuntowały się i rozpoczęli wojnę ze swoimi panami. Teraz Cylony ewoluowały w bardziej ludzką postać, które starają się eksterminować prawdziwych biologicznych ludzi. W tym celu używają ludzkiego naukowca, Gajusza, aby pomóc jednemu z ich infiltratorów, znanym jako # 6, w penetracji mistrza Kolonii ...