Kudłaty przeżył ostatnio za dużo stresu, więc lekarz zaleca mu wypoczynek. Przyjaciele zabierają go do ośrodka SPA w małym, spokojnym miasteczku La Serena, gdzie prowadzone są też wykopaliska paleontologiczne. Niestety, wkrótce pojawia się Pantozaur – legendarny dinozaur, strzegący skarbów w pustynnych jaskiniach. Ponieważ jednak Scooby jest zajęty niańczeniem przerażonego Kudłatego, a Velma, zakochana po uszy w studencie paleontologii, ledwie kontaktuje z rzeczywistością, wygląda na to, że tym razem Fred i Daphne będą musieli rozwiązać tę zagadkę we dwójkę...

Bohaterowie wyjeżdżają na wakacje i zatrzymują się w hotelu, w którym Scooby-Doo i Kudłaty chcą dobrze wypocząć. Jednak tutaj spotykają strasznego starożytnego potwora Pantasaurusa, który według legendy został wezwany przez starożytnych Indian. W ten sposób rdzenni mieszkańcy Ameryki próbowali odpędzić hiszpańskich konkwistadorów.