Ekranizacja książki Bohumila Hrabala. Czechosłowacja w czasach niemieckiej okupacji. Młody Miloš Hrma (Václav Neckář) rozpoczyna pierwszą w życiu pracę na niewielkiej stacji kolejowej Kostomlaty. Bardziej niż sprawy wojny czy polityki interesują go własne zmartwienia, typowe dla wieku dorastania i związane przede wszystkim z inicjacją seksualną, a także platoniczną miłością do konduktorki imieniem Máša (Jitka Bendová).

"Pociągi pod specjalnym nadzorem" to komediodramat o młodym człowieku pracującym na małej stacji kolejowej podczas II Wojny Światowej. Jest nim Miloš Hrma, uczeń dyspozytora stacji w okupowanej Czechosłowacji, pragnący uwolnić się od swego dziewictwa. Chcąc zapomnieć o wojnie i walce o przetrwanie, wyrusza na erotyczne poszukiwania, by poznać samego siebie, odkrywając przy tym świat erotyzmu i... frustracji. Podczas tej wyprawy Miloš niespodziewanie zostaje wciągnięty w spisek, którego celem jest wysadzenia niemieckiego pociągu z amunicją.

Miloš Hrma – młody absolwent szkoły kolejowej – zostaje skierowany na miesięczną praktykę na maleńkiej stacji na czeskiej prowincji. Tu uczy się nie tylko tajników zawodu, ale przede wszystkim sztuki życia. Gdzieś w dalekim tle przetacza się II wojna światowa. Trywialną rzeczywistość, zabawną i nabrzmiałą od erotycznych podtekstów, wkrótce dosięgnie wojenne okrucieństwo.

Pełna ironii historia wstydliwego młodzieńca, który wywodząc się z rodziny nieudaczników i głupków odnosi sukces w łóżku, ale traci życie. Akcja toczy się w czasach II wojny światowej na wiejskiej stacyjce: to ten rodzaj skromnych filmów, które pokazując ludzkie problemy i poczciwość, lecz potrafią uwieść hollywoodzką Akademię. Zarazem ludowa przypowieść o małomiasteczkowej mentalności, z elementami błyskotliwego humoru, gdzie dyżurny ruchu stempluje pupę telegrafistki.