„Lobotomia” opowiada o operacji propagandowej, towarzyszącej wojnie rosyjsko-gruzińskiej w sierpniu 2008. Autorzy porównują unikalne zdjęcia otrzymane od MSW Gruzji z obrazkami, jakie na ekranach swoich telewizorów mogli zobaczyć widzowie rosyjskich stacji telewizyjnych i starają się zrozumieć, dlaczego mieszkańcy postsowieckich republik tak łatwo poddają się manipulacji ze strony mediów.
Operację propagandową prowadzoną przez rosyjskie media, autorzy filmu przyrównują właśnie do tytułowej lobotomii – operacji polegającej na chirurgicznym rozdzieleniu poszczególnych części mózgu, w wyniku czego u chorego psychicznie pacjenta redukowano procesy myślowe i emocje. Skutkiem ubocznym zabiegu była jednak utrata poczucia ciągłości własnego „ja”. Zdaniem autorów, rosyjska propaganda telewizyjna, działa na widzów rosyjskich programów informacyjnych podobnie jak opisany zabieg chirurgiczny – redukując ich procesy myślowe.