Film "Błękitna Głębia 2: Rafa"opowiada historie Sebastiana (Chris Carmack) i Dani (Laura Vandervoort), którzy są młodą parą i łączy ich jedna wspólna pasja - nurkowanie. W zamian za spore wynagrodzenie podejmują się poszukiwań skarbu Krzysztofa Kolumba, który ma znajdować się w okolicy rafy otaczającej zamieszkaną przez nich wyspę. W wyprawie biorą udział także inni nurkowie. Dla wszystkich jest to test charakteru i umiejętności.

Na dnie oceanów wciąż spoczywają warte miliardy dolarów zatopione skarby, pobudzające wyobraźnię i marzenia o wielkich bogactwach. Śmiałków gotowych narażać własne życie dla sławy i pieniędzy nie brakuje. Trzymająca w napięciu "Błękitna głębia 2" to historia głębinowych nurków, którzy są profesjonalistami w swoim fachu, a przy tym kochają ryzyko i wielką przygodę i bez wahania podejmą się każdego zadania. Do Sebastiana i Dani, bo właśnie o nich powyżej mowa, zgłasza się niejaki Carlton w towarzystwie Azry, proponując im dużą sumę pieniędzy za pomoc w odkryciu legendarnych kosztowności, od wieków spoczywających na dnie Oceanu Spokojnego. Szybko okazuje się, że nie tylko oni poszukują zatopionego skarbu. Sebastian i Dani psują szyki mafii i ich przygoda zamienia się w pełną niebezpiecznych pułapek szkołę przetrwania. Na ciężką próbę zostają wystawione nie tylko umiejętności zawodowe nurków, ale również ich miłość i wola życia.