Shibusen to specjalna szkoła dla "Mistrzów broni", prowadzona przez Shinigamiego – "Boga śmierci". To właśnie tutaj, pod czujnym okiem nauczycieli, trenują swoje rzemiosło przyszli pogromcy zła. Spośród uczniów tej szkoły w sposób szczególny wyróżniają się Maka, Soul Eater, Black Star i Tsubaki - grupa przyjaciół, do których następnie dołączy "Syn śmierci" wraz z dwiema towarzyszkami. Bohaterowie przez mozolną i ciężka pracę zdobywać będą wiedzę i umiejętności niezbędne w życiu każdego wojownika. Nie wiedzą jednak, jak wielkie niebezpieczeństwo kryje się tuż obok nich, jak potężna siła czeka, by się przebudzić.